5个总冠军，分别在1999年 2003年 ，2005年 ，2007年 2014年夺冠。

2006-07赛季，马刺开局14场比赛中赢了11场。12月2日战胜国王队后，马刺超越凯尔特人，以59.5%的胜率成为了NBA历史上常规赛胜率第二高的球队。在常规赛末段的31场比赛中，马刺成为了联盟里胜率最高的球队（25胜6负），最终以联盟第一的防守和58胜24负的常规赛战绩进入季后赛。首轮比赛马刺4比1淘汰丹佛掘金队。次轮邓肯以场均30.2分12.5个篮板3.1记盖帽带领马刺4-2淘汰菲尼克斯太阳队。西部决赛马刺4-1轻取犹他爵士。随后在总决赛中以4比0横扫勒布朗·詹姆斯率领的克利夫兰骑士队，再夺总冠军，成为NBA历史上继凯尔特人、湖人、公牛队后，第四支夺得4次及以上总冠军的NBA球队。

历史上NBA东西部决赛中出现4比0的情况并不少见，以下是几个典型的例子：1. 2007年，NBA总决赛中，圣安东尼奥马刺以4比0横扫克利夫兰骑士队，夺得总冠军。2. 2002年，NBA西部决赛中，洛杉矶湖人队以4比0横扫圣安东尼奥马刺队，晋级总决赛。3. 1989年，NBA东部决赛中，底特律活塞队以4比0横扫芝加哥公牛队，晋级总决赛。4. 1977年，NBA东部决赛中，费城76人队以4比0横扫休斯顿火箭队，晋级总决赛。需要注意的是，这些例子并不代表4比0的比分是常态，只是发生过的个别情况。在NBA历史上，东西部决赛中出现3比0或3比1的情况更为常见，这种情况下通常会出现紧张的反扑战。